あらすじ（引用：wikipedia）

攻性の特殊部隊「攻殻機動隊」誕生以前の物語が、ついに始動!
戦闘型サイボーグのバトーが、まだレンジャー部隊で活躍していた時代。
内戦がつづくクラン共和国に外務大臣救出の任務を帯びて送り込まれたバトーが、ある女性と出会う。
501機関所属の草薙素子。それは、攻性部隊「攻殻機動隊」が誕生するきっかけとなる運命の出会いであった。